RBR-10t3wc7z Development and evaluation of flexible sensor devices and construction of plasmid positive controls for molecular diagno...

Date of registration: 08/18/2023 ^(mm/dd/yyyy)
Last approval date : 08/18/2023 ^(mm/dd/yyyy)

Study type:

Observational

Scientific title:

Trial identification

• UTN code: U1111-1292-4906

• Public title:

  en

  Development and evaluation of flexible sensor devices and construction of plasmid positive controls for molecular diagnosis and detection of residual disease in Leukemia

  pt-br

  Desenvolvimento e avaliação de dispositivos sensores flexíveis e construção de controles positivos plasmidiais para o diagnóstico molecular e detecção da doença residual na Leucemia

• Scientific acronym:

• Public acronym:
• Secondaries identifiers:
  • 40319220.3.0000.5201
    Issuing authority: Plataforma Brasil
  • 4.592.419
    Issuing authority: Comissão Nacional de Ética em Pesquisa
  • 40388420.5.0000.5190
    Issuing authority: Plataforma Brasil
  • 4.654.692
    Issuing authority: Comitê de Ética em Pesquisa do Instituto Aggeu Magalhães
  • 40319220.3.3001.5208
    Issuing authority: Plataforma Brasil
  • 4.638.771
    Issuing authority: Comissão de Ética em Pesquisa da Universidade Federal de Pernambuco

Sponsors

• Primary sponsor: Instituto Aggeu Magalhães - Fiocruz de Pernambuco
• Secondary sponsor:
  • Institution: Instituto de Medicina Integral Prof. Fernando Figueira - IMIP
  • Institution: Universidade Federal de Pernambuco
• Supporting source:
  • Institution: CNPQ- Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

Health conditions

• Health conditions:

  en

  Lymphoblastic Leukemia

  pt-br

  Leucemia Linfoide

• General descriptors for health conditions:

  en

  C95.9 Leukemia, unspecified

  pt-br

  C95.9 Leucemia, não especificada

• Specific descriptors:

  en

  C04.557.337.428 Lymphoblastic Leukemia

  pt-br

  C04.557.337.428 Leucemia Linfoide

Interventions

• Interventions:

  en

  This is a study to evaluate a new diagnostic device. In the first stage, the patient's bone marrow samples will be collected and assessed for the presence of chimeric genes by the conventional PCR method for diagnostic purposes as part of the service's routine. They will be evaluated by the new test method (genosensor) for concordance calculation. It is expected to analyze groups of patients with samples known to be positive and known to be negative in a ratio of 1:1 for the different translocations considered by the test, with blind analysis for the test operator. The accuracy of the qualitative prototype and the concordance (Kappa test) with a reference test based on conventional PCR, the limits of detection and quantification will be evaluated. The result of this step will serve as proof of principle for the design of a field validation study in sites with no structured molecular biology laboratory. In the second stage, plasmid controls will be built for the chimeric targets considered as a reference for calculating measurable residual disease in different laboratories. The criteria for harmonizing the variables that interfere in the interpretation of the result will be evaluated through the distribution of samples to other laboratories and evaluation of the performance of the various stages of execution, reproducibility, repeatability, and identification of interference factors in the assessment of residual disease in studies in partnership between institutions. Patients with leukemia will be characterized for chimeric genes at diagnosis, and patients with known genetic alteration will undergo molecular reassessment after treatment cycles to calculate residual disease. Participating centers will exchange samples to evaluate differences in sample preparation, equipment used, sample quality after transport, repeatability, reproducibility, accuracy, calculation, and interpretation of results. The experiments will be carried out for three years, with positive samples from each center; the number of samples examined is variable. It depends on the frequency of the type of leukemia each service attends, but it is expected to test at least 200 patients with translocations. Considering that the IMIP (secondary sponsor) serves about 80 children with leukemia per year, with 80% of cases of B-cell leukemia and only 25% positive for some chimeric target gene, 48 samples would be analyzed in 3 years in just 1 study site, being feasible to assume the performance of 200 patients with the participation of other centers. The results will serve to harmonize the test execution protocols and to measure the quality control of the test in the different collaborating sites of the Brazilian group for the treatment of childhood leukemia.

  pt-br

  Este é um estudo para avaliar um novo dispositivo de diagnóstico. Na primeira etapa, amostras de medula óssea do paciente serão coletadas e avaliadas quanto à presença de genes quiméricos pelo método de PCR convencional para fins diagnósticos na rotina do serviço. Eles serão avaliados pelo novo método de teste (genossensor) para cálculo de concordância. Espera-se analisar grupos de pacientes com amostras sabidamente positivas e sabidamente negativas na proporção de 1:1 para as diferentes translocações consideradas pelo teste, com análise cega para o operador do teste. Serão avaliados a acurácia do protótipo qualitativo e a concordância (teste Kappa) com um teste de referência baseado em PCR convencional, os limites de detecção e quantificação. O resultado desta etapa servirá como prova de princípio para o desenho de um estudo de validação de campo em locais sem laboratório de biologia molecular estruturado. Na segunda etapa, serão construídos controles plasmidiais para os alvos quiméricos considerados como referência para cálculo de doença residual mensurável em diferentes laboratórios. Os critérios de harmonização das variáveis que interferem na interpretação do resultado serão avaliados por meio da distribuição de amostras a outros laboratórios e avaliação do desempenho das diversas etapas de execução, reprodutibilidade, repetibilidade e identificação de fatores interferentes na avaliação do doença residual em estudos em parceria entre instituições. Pacientes com leucemia serão caracterizados por genes quiméricos no momento do diagnóstico, e pacientes com alteração genética conhecida serão submetidos a reavaliação molecular após os ciclos de tratamento para calcular a doença residual. Os centros participantes trocarão amostras para avaliar as diferenças na preparação da amostra, equipamento usado, qualidade da amostra após o transporte, repetibilidade, reprodutibilidade, precisão, cálculo e interpretação dos resultados. Os experimentos serão realizados por três anos, com amostras positivas de cada centro; o número de amostras examinadas é variável. Depende da frequência do tipo de leucemia que cada serviço atende, mas a expectativa é testar pelo menos 200 pacientes com translocações. Considerando que o IMIP (patrocinador secundário) atende cerca de 80 crianças com leucemia por ano, sendo 80% dos casos de leucemia de células B e apenas 25% positivo para algum gene alvo quimérico, seriam analisadas 48 amostras em 3 anos em apenas 1 estudo local, sendo viável assumir a atuação de 200 pacientes com a participação de outros centros. Os resultados servirão para harmonizar os protocolos de execução do teste e medir o controle de qualidade do teste nos diferentes sites colaboradores do grupo brasileiro para o tratamento da leucemia infantil.

• Descriptors:

  en

  V03.950 Validation study

  pt-br

  V03.950 Estudo de Validação

Recruitment

• Study status: Not yet recruiting
• Countries
  • Brazil
• Date first enrollment: 10/01/2023 ^(mm/dd/yyyy)

• Target sample size:	Gender:	Minimum age:	Maximum age:
  200	-	0	20 Y

• Inclusion criteria:

  en

  Patients with a maximum age of 20 years; both genders; attended at reference services for the treatment of leukemia in Brazil with a clinical and cytological diagnosis of leucemia; who express the desire to participate in the project and the legal guardians sign the Free and Informed Consent Form and the children between 8 and 18 years old sign the Free and Informed Assent Term, providing clinical information, and allowing the analysis of samples (bone marrow) in the laboratory reference of the study in Recife

  pt-br

  Pacientes com idade máxima de 20 anos; ambos os gêneros; atendidos nos serviços referências para tratamento de leucemia no Brasil com diagnosticado clínico e citológico de leucemia; que expressem o desejo de participar do projeto e os responsáveis legais assinarem o Termo de consentimento livre e esclarecido e as crianças entre 8 e 18 anos assinarem o Termo de assentimento livre e esclarecidos, fornecendo informações clínicas e permitindo a análise de amostras (medula óssea) no laboratório referência do estudo em Recife

• Exclusion criteria:

  en

  Patients with mature B-cell Leukaemia

  pt-br

  Pacientes com Leucemia de células B madura

Study type

• Study design:

• Expanded access program	Purpose	Intervention assignment	Number of arms	Masking type	Allocation	Study phase

Outcomes

• Primary outcomes:

  en

  Evaluate the accuracy and effectiveness of molecular qPCR testing for detecting measurable residual disease by harmonizing test performance parameters performed in different laboratories

  pt-br

  Avaliar a acurácia e a efetividade de teste molecular de qPCR para detecção de doença residual mensurável através da harmonização dos parâmetros de performance do teste executados em diferentes laboratórios

• Secondary outcomes:

  en

  No secondary outcomes expected

  pt-br

  Não são esperados desfechos secundários

Contacts

• Public contact
  • Full name: Norma Lucena-Silva
  • • Address: Av. Moraes Rego, s/n, Cidade Universitária
    • City: Recife / Brazil
    • Zip code: 50740-465
  • Phone: +55(81)21012618
  • Email: norma.silva@fiocruz.br
  • Affiliation: Fundação Oswaldo Cruz de Pernambuco
   
• Scientific contact
  • Full name: Norma Lucena-Silva
  • • Address: Av. Moraes Rego, s/n, Cidade Universitária
    • City: Recife / Brazil
    • Zip code: 50740-465
  • Phone: +55(81)21012618
  • Email: norma.silva@fiocruz.br
  • Affiliation: Fundação Oswaldo Cruz de Pernambuco
   
• Site contact
  • Full name: Norma Lucena-Silva
  • • Address: Av. Moraes Rego, s/n, Cidade Universitária
    • City: Recife / Brazil
    • Zip code: 50740-465
  • Phone: +55(81)21012618
  • Email: norma.silva@fiocruz.br
  • Affiliation: Fundação Oswaldo Cruz de Pernambuco
   

Additional links:

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